Vou descrever aqui como usar o SWFUpload com CakePHP 1.2. Para facilitar, fiz um zip com todos arquivos necessários. Você pode baixá-lo aqui.
Neste arquivo, existe os arquivos de terceiros (pasta vendors) e na pasta app existem os arquivos necessários para sua aplicação.
Note que na pasta config, há o arquivo bootstrap.php. Nele eu só coloquei as configurações de pasta. Caso sua aplicação use mais alguma outra coisa no bootstrap, não esqueça de fazer um merge.
Na pasta webroot, o arquivo JS é o responsável pelas ações (cancelar, envio OK, envio NOK, etc), então dependendo da sua aplicação vai ser preciso alterá-lo. O CSS é a mesma coisa…
Acho que era isso. Caso tenham alguma dúvida, não exitem em perguntar. Abraços e boa sorte a todos.